拳皇2001

    这一版本是“ness篇”三部曲的完结篇。与之前的援护攻击系统相比，可以更加自由的对战（采用了4对4的战略组合援护系统，可以组成在至今为止的“拳皇”系列中从未出现过的援护组合模式）。

    此外，在连续技系统中加入了“ireaa”，实现了新的攻击进化。

    在“拳皇2000”大赛期间，一座城市被卫星兵种erann摧毁了。但是各国报纸却掩饰说这是由人工卫星坠落所引发的事故。

    虽然“马上终止必然会出事的拳皇大赛”的呼声不少，但讽刺的是，这个备受争议的大会再度受到人们的关注，而且狂热程度甚至超过了97年。

    但是，在这个世界规模的大赛中，一个惊人的事实被逐渐揭露出来：神秘组织“ness”竟然也以战队身份出战！！

    大赛主办者的真正目的到底是什么呢？这次大会无法保证惨剧不会再度发生。。。。。。

    “拳皇ness”三部曲，在本次大赛后将正式完结

    拳皇2002

    重新采用“拳皇”3对3的战斗模式。新加入了在任何情况下都可以自由地使用的“快速紧急回避”“快速ax超必杀技”这两种独特的系统，使得“拳皇2002”成为拳皇系列最高水准的版本。

    拳皇2003

    在这一版本中加入了“任命队长系统”，赋予队长优于普通队友的队长技能。此外，还加入了可以在3对3的对战过程中随时换人的“ulishif系统”。这样可以通过随意调换角色，快速地展开游戏。继“大蛇篇”“ness篇”之后，在该版本中出现了新的主人公—阿修，新一轮的故事将围绕他逐步展开。

    世界规模最高水准的格斗大赛—“拳皇大赛”。

    卢卡尔被击溃、大蛇被封印、神秘组织“ness”也土崩瓦解，故事一步步依次展开。但是这些黑暗的力量总是隐没在黑幕之后，暗暗地涌动着。

    即便如此，今年同样决定要召开新一届的“拳皇大赛”。

    大赛的主办者依然神秘莫测，于是世界各地充满了各种传言。

    但是身经百战的各地格斗高手们依然陆续出现，准备参战。得知已经有众多著名的格斗家参赛的各路媒体，一改之前小心谨慎的姿态，立刻将目光转向本届“拳皇大赛”。

    当大赛对外宣布本届将采取“ulishif制度”（即自由替换制度）的新规则之后，立刻引起全球性的大轰动，成为了大家津津乐道的最热话题。

    围绕大赛的进展情况以及各个战队的战术战略，各大报纸杂志争相出版每周特集。而各大频道，突然推出众评论家激烈争辩解说的节目。

    “在这个世上，还有许多异常强大的格斗高手啊”。

    牙刀、假面翼狮、堕珑、神武，还有阿修?克林森。

    这些陌生的名字通过本次大赛的骚动在网络迅速蹿红。他们是在大赛中引起骚乱的后起之秀？还是。。。。。。？

    在整个世界陷入狂热的同时，大赛的准备工作正在有条不紊地进行着。

    敲定各地方大赛场地和比赛日程之后，各地的格斗迷们都陆续向初战地进发。

    为了表现出街头格斗的气氛，主办方将比赛场所设在了市内。成千上万的观众涌入设在各地的可容纳数万人的体育馆，通过巨大的电视屏幕观看比赛的现场直播。

    2003年12月。今年大赛的帷幕再次升起。

    拳皇xi

    这是拳皇系列的第十一个版本，“阿修篇”的第二章。这一版本采用了拥有更高战略性的五大新系统：

    “ikshif系统”---可以随时切换出场人物；

    “sagshif系统”---在攻击中处于无敌伤害的状态；

    “reaanel系统”---普通超必杀和队长超杀技能的联合；

    “skillgau系统”---可以实现各种换人、取消等操作；

    “juniar系统”---（不再以剩余血量的多少为标准来判定胜负的新判断准则）等。

    神秘组织成员—无界，成功解除了大蛇的封印。趁此混乱之际，阿修?克林森盗取了“八尺神镜”的能量。这一系列事件致使上届大赛在主办者、神乐千鹤受伤等混乱的状况下落下帷幕。

    时光流转，今年会照常召开“拳皇大赛”。随着新人物的不断出现，参赛者名单也渐渐清晰。

    以如月影二的复出为开端，初次参赛人员有奥斯瓦德、潘洁妮、鸭王、桃子，以及伊丽莎白。

    久经考验的格斗高手们，被秘密的威胁卷进这个世界最高水平的格斗大会，他们到底有什么目的呢？同时也正因为他们的出现，大赛出现了前所未有的盛况。

    在光鲜华丽的外表下，暗藏着各种鬼胎。被称为“遥之来者”的神秘组织，将会有什么样的行动呢？

    解除封印后的大蛇会转向攻击缺了一件的三神器吗？

    此外，阿修克林森的真正目的到底是什么呢？

    “拳皇xi大赛”即将开始，战斗之门将再度打开。

    拳皇xii

    这是拳皇系列的第12个版本。以“拳皇重生”为主题，并未设定具体的剧情，旨在开发一款终极对战游戏。该版本定位为“史上最高规格的2对战游戏”，采用了前所未有的超炫、流畅的2格斗画面，并撤销了前版本中的“自由轮换系统”，恢复为传统的淘汰制团队战模式。另外，由近身战衍生出的“riianer”、可以使对手的全部打击技能无效化的反击技“guaraak”、强攻击以上技能相撞时会发生“抵消”等新元素，也被积极地加入进来，最终创造出可以尽情享受相互格斗和策略运用乐趣的新版本。

    拳皇中，祸忌先是被草薙京、八神庵击败，又被紫苑投出的长枪所贯穿后失掉其生命，紫苑则消失于次元的裂缝。但是余下的一族们像嘲笑一般夺走了由海顿所率领的调查部队的努力成果，现身于其面前。他们所说的遥远彼之地是什么?为何要执着的要寻求大蛇之力呢?

    另一方面，八神因为受活性的大蛇之血支配而暴走，将本来就精疲力尽的草薙京击倒在地，阿修·克里门森突然出现，打败了暴走八神庵(此时八神虽暴走，但体力也消耗得差不多)并夺其神器及苍炎，摆脱伊丽莎白的阻止。随着神乐之后，已得到八神力量。 八咫之镜已破。八咫琼勾玉已碎三种神器之中只余下草薙之剑。

    时期到来了。相继的遭遇事故，一直被担心能否举行的kf大会。可是，被某人强行推动下，kf大会竟相反的成为史上最大的形式来进行。以世界各地为擂台，在空前绝后的规模下举行的异种格斗大会在前所未有的华丽报道下升温。然后，第13届拳皇大会(拳皇xiii)的挑战书送往强者们……

    那寄信人正是(r) 在大会进行到最后，时间突然静止，遥远彼之地的首领率众成员出现，而首领竟是阿修的祖先saiki，原来阿修在拳皇2003、xi夺取2个神器一方面是为了迷惑祖先认为自己是听话的，一方面增强实力以打败saiki。

    saiki企图用活祭的方式以达成自己的阴谋，不料紧要关头，阿修从背后偷袭了saiki，本以为事情就此了结，意外又发生了，阿修夺取了saiki的冥炎力量后竟被saiki反噬，变成了ark ash，成了kfxiii的最终bss;最后阿修凭毅力控制主权，消灭了saiki，勃于外祖母定律(时间悖论)的阿修在祖先死后亦消失于除伊丽莎白几人的所有人的记忆中。

    一切迷雾最终得以揭开，ash篇宣告结束……